hi-c最新消息报道_hi-c测序原理(2025年02月热点汇总)
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致辞结束后,安诺优达生产交付中心总经理唐四东先生与华大智造中国销售副总经理赵明先生共同为单细胞和Hi-C领域高通量测序技术致辞结束后,安诺优达生产交付中心总经理唐四东先生与华大智造中国销售副总经理赵明先生共同为单细胞和Hi-C领域高通量测序技术共有194家省级以上众创空间参评,我校Hi-C空间获评优秀(A类),是省内获此评价的四所高校之一。消费者们终于得偿所愿了——人们本该满意,不过新的需求又出现了:把我们最爱的甜甜橙汁汽水Hi-C还回来!大幅度降低了植物Hi-C的实验成本。 FS-Hi-C克服了传统Hi-C对新鲜样本要求的限制性(样本只需液氮速冻保存即可),填补了该领域利用大幅度降低了植物Hi-C的实验成本。 FS-Hi-C克服了传统Hi-C对新鲜样本要求的限制性(样本只需液氮速冻保存即可),填补了该领域利用该研究结合三代测序技术(ImageTitle ImageTitle)和Hi-C技术构建出由12条染色体水平组成的雌性(XX)东亚飞蝗的高质量基因组,最后,通过多组学数据整合,包括纳米孔测序,BioNano光学图谱技术,全基因组测序及Hi-C,该研究对脂肪肉瘤细胞系Lipo863B的A和:斜口裸鲤和花斑裸鲤的矩阵图;和:转换区域内基因的表达水平;:转内基因的功能富集分析;:和中变化的比例;和:和中保守Nucleolin为核仁特异的指示蛋白)(图片来源:参考资料[1]) 相较于in situ Hi-C,nHi-C提供了核仁介导的染色体之间相互作用(trans图4 nHi-C与in situ Hi-C trans互作热图比较(图片来源:参考资料[1]) ▲图5 (左)不同染色体之间的trans互作水平;(右)核仁周围图4 nHi-C与in situ Hi-C trans互作热图比较(图片来源:参考资料[1]) ▲图5 (左)不同染色体之间的trans互作水平;(右)核仁周围本次评选自去年10月启动,经过自主申报、材料提交、资格审核、专家评审、结果公示等步骤,大连海事大学Hi-C空间获评中国双创大连海事大学“Hi-C空间”经过多年建设,运营模式特色鲜明、优势突出。学生创新创业项目年均立项1000余项,其中创业孵化项目近利用SNP和Hi-C对组装后的contig进行分型,之后使用Hi-C挂载。安诺优达实测数据发现,AUPPA的block N50最高,超过其他三个方法近日,我校创新创业工作再传喜讯,我校Hi-C空间在大连市科技局组织开展的2021年度大连市众创空间考核评价中,从55家参评单位中兰多科研团队利用二代测序、ImageTitle测序、Hi-C测序等多种测序手段,在国际上率先组装了绿煤102和翠绿101两份芦竹基因组,两(C) 使用Hi-C三维基因组信息组装的9条沙冬青染色体;(D) 基因组的注释和基因组内部的共线性关系。 比较基因组学分析显示,虽然沙该研究利用ImageTitle测序数据和Hi-C辅助组装技术,获得马铃薯甲虫染色体基因组1,008.42Mb,Scaffold N50达到58.32Mb。注释在会议报告环节中,安诺优达市场运营总监裴素蕊博士以及华大智造中国营销中心产品经理徐媛博士为与会观众展示了中国基因科技的大连海事大学Hi-C空间(创新创业孵化基地)成功获批国家备案众创空间。这是我校在创新创业领域继获批全国创新创业典型经验高校(图2 染色体的空间结构变化随着分化而减弱 本研究基于ImageTitle测序、Hi-C等多组学技术,首次实现了基于实验室生物学手段,构建图2 Hi-C技术鉴定倒位、缺失和随机扩增的示例 在比较和整合不同平台的数据之后,平均在每个细胞系中鉴定出几千个插入和缺失(>该研究以猪为模型,利用Hi-C、ImageTitle-seq和RNA-seq等技术,系统探究了精原干细胞和分化精原细胞的染色质三维空间结构,并该研究通过对甘蓝型油菜高油材料N53-2(含油量超过50%)和低油材料Ken-C8(含油量40%左右)的Hi-C和ATAC-seq技术分析,研究人员通过综合运用ImageTitle单分子DNA测序、Hi-C三维基因组测序、Illumina短片段测序、Bionano内切酶酶切位点图谱等测序技并基于Hi-C测序,构建了凡纳滨对虾和中国明对虾染色体水平的基因组图谱。通过比较基因组学分析,推断SSR的爆发式扩张发生在对虾随后徐媛博士介绍了DNBSEQ-T7作为一款超高通量测序平台,在通量、灵活性以及测序速度上面的核心优势,展示了DNBSEQ-T7迄今榮獲中國雙創典型示範基地的有:大連海事大學Hi-C空間、東北大學東創空間、江寧合夥人眾創空間、金橋電子商務産業園、萌恒數字该研究首先利用二代Illumina、三代ImageTitle和Hi-C测序技术完成了“早上海水蜜”的基因组组装,其Scaffold N50达到29.68 Mb,略光学图谱技术以及Hi-C技术的结构变异检测方法,并首次提出了基于Hi-C数据进行全基因组结构变异检测的算法,同是也对三种方法的研究人员采用ImageTitle ImageTitle、Bionano光学图谱、Hi-C等多种测序技术,有效弥合了重叠群和染色体之间的尺度差异,最后成功综合利用二代、三代、Hi-C等测序技术,组装得到了染色体级别的高质量参考基因组,首次构建了Glycine泛基因组。鉴定出109,827个Hi-C矩阵经过最短路径法转换得到染色质区域的空间相互距离,再利用分子布朗运动的假设,得到马尔可夫模型的状态转移概率,最后Hi-C, ONT数据,完成了两个端粒至端粒无缺口猕猴桃基因组拼接,同时获得了染色体级别的单倍型基因组。研究发现,维生素合成途径利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列。利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列。利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列。该团队研究收集了8个野生番茄种、1个番茄近源野生种和2个栽培番茄代表性品种,利用ImageTitle、Bionano和Hi-C测序技术,组装了进一步的Hi-C测序发现,单位点修饰的H3K56bhb便足以引起染色体三维结构的变化(图5)。早在2018年,高分辨率日冕成像仪(Hi-C)就捕获了这一原始数据。正如它的名字所告诉我们的那样,高分辨率日冕成像仪是一架可专家利用三代ImageDescription数据、Illumina数据和三维基因组Hi-C数据,组装获得梅花鹿高质量染色体级别参考基因组,染色体挂载专家利用三代ImageDescription数据、Illumina数据和三维基因组Hi-C数据,组装获得梅花鹿高质量染色体级别参考基因组,染色体挂载专家利用三代ImageDescription数据、Illumina数据和三维基因组Hi-C数据,组装获得梅花鹿高质量染色体级别参考基因组,染色体挂载他带领团队成功开发多项技术发明专利,应用于基因组组装技术、基因组重测序分析技术、Hi-C技术以及肿瘤检测相关的产品,且在生命光学图谱与Hi-C三维基因组联合分析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而对400多份种质资源开展了基因组变异分析,共鉴定近光学图谱与Hi-C三维基因组联合分析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而对400多份种质资源开展了基因组变异分析,共鉴定近光学图谱与Hi-C三维基因组联合分析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而对400多份种质资源开展了基因组变异分析,共鉴定近光学图谱与Hi-C三维基因组联合分析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而对400多份种质资源开展了基因组变异分析,共鉴定近10月20日下午我院在Hi-C空间多功能厅成功举办“唯才唯青岛杯”第十四届大连海事大学学生职业生涯规划大赛航运经济与管理学院2019年,学校获评全国创新创业典型经验高校(50强),2020年学校Hi-C空间获评国家级众创空间,2022年获批首批“国家级创新图1. DM8.1基因组完成图 研究首先利用ONT ultra-long reads进行三代组装和Hi-C挂载,获得了基因组大小、完整度和连续性均显著此研究结合二代、三代基因组测序和Hi-C数据,组装了包含22条染色体2.13 Gb的中华水韭四倍体基因组,其scaffold N50达到86.66为了检测增强子劫持事件,研究人员通过异常的Hi-C信号预测了SV,并利用同一实验室研发的软件预测SV 诱导的新染色质环,随后在10月18日下午,创新创业学院在Hi-C空间多功能厅举办了科创项目开展与技能实训系列活动第一期之“科创项目的开展流程与团队组建利用Hi-C,他们研究了基因组构型在感染期间如何与CD8+ T细胞分化相结合,并研究了CTCF(一种关键的染色质重塑因子)通过CTCF敲研究员 北京大学第三医院生殖医学中心 任北京大学第三医院临床干细胞研究中心常务副主任,生殖内分泌与辅助生殖技术北京市重点本研究利用ImageTitle+ImageTitle+Hi-C+Illumina多层级的策略完成了首个人工合成多倍体的染色体水平基因组组装,并对其亚基因组b). Hi-C验证3号染色体倒位准确性。c). 基于624份自交后代的重组率分布图,3号染色体倒位区域附近重组率显著降低 | 参考文献[1]结合Hi-C互作图谱技术辅助基因组组装,分别构建了野牦牛和家牦牛高质量染色体水平参考基因组(分别命名为NWIPB_ImageTitle和结合Hi-C互作图谱技术辅助基因组组装,分别构建了野牦牛和家牦牛高质量染色体水平参考基因组(分别命名为NWIPB_ImageTitle和该研究基于三代长读长测序和Hi-C技术,获得了羊踯躅杜鹃花端到端gap-less基因组组装。该基因组组装大小为653.46 Mb,99.48%的Hi-C辅助组装技术组装到染色体水平基因组(图1a)。基因家族鉴定及分析结果表明,龙眼中的苯丙烷类生物合成相关基因家族数量Hi-C辅助组装技术组装到染色体水平基因组(图1a)。基因家族鉴定及分析结果表明,龙眼中的苯丙烷类生物合成相关基因家族数量他们采用了Hi-C(染色质构象捕获),这是一种评估DNA和蛋白质组合以探究三维基因组结构的标准方法,适用于纳米孔测序或长而连续研究中,科研团队利用二代Illumina、三代ImageTitle、Hi-C和10ImageTitle等最新的基因组测序数据,通过优化基因组组装策略,完成西电学子在计算生物信息学领域顶级期刊发表成果 该方法被用于17个人类血液细胞promoter-capture Hi-C图谱。该研究指出ImageTitle当前上线的产品类型涵盖单细胞测序、动植物基因组测序、人基因组测序、外显子组测序、转录组测序、宏基因组测序、HI-C测序以及该研究采用Illumina, Nanopore和Hi-C等多种测序技术对云杉花墨天牛进行了基因组测序与组装,并将组装结果挂载到10条假染色体上利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并10x genomeics(130X)和Hi-C染色体构象捕获技术(176X),总计产生了近3 Tb的测序数据量。 最终,基因组组装大小约4.55 Gb据黄振宇博士介绍,研究团队首先利用二代、三代及Hi-C等测序技术绘制了李杏种质改良团队自主选育品种‘中李6号’基因组图谱,其近日,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)魏辅文院士团队研究利用三代ImageTitle结合Hi-C测序技术,首次获得了箱鲀科鱼类的该研究不仅成功组装了中国大豆品种ZH13的T2T基因组,还绘制了首个完整的表观遗传修饰图谱,解析了大豆复杂区域(着丝粒与端粒然后利用统计网络对原始测序数据实现染色体级别的分离,该网络模型同时也可以Hi-C、Bionano、近亲或者同物种参考基因组组信息该研究通过ImageTitle三代测序和Hi-C辅助基因组组装,测序获得花楸树全长基因组序列,大小为660 Mb,定位于17条染色体,contig安诺优达深度参与了本次研究,包括ImageTitle三代测序、Hi-C辅助组装以及RNA-seq、WGBS等多组学测序及该基因组的组装、注释等狮头鹅基因组大小为1.2 G,结合染色体构象技术(Hi-C),得到40条染色体的高质量基因组,并成功绘制出狮头鹅全基因组精细图谱。此外黄捷、蒋永鹏为稍早前BAT Hi-C方法学文章的共同第一作者。以上研究受到国家自然科学基金、科技部重点研发计划、北大-清华2020年,李兴旺教授和李国亮教授课题组与杨芳教授课题组合作,用DLO Hi-C技术描绘了玉米雌雄穗的三维基因组图谱。 鉴于课题组在2020年,他们和杨芳教授合作,又用DLO Hi-C技术描绘了玉米雌雄穗的三维基因组图谱,相关研究成果得到了国内外同行的高度评价。当前上线的产品类型涵盖单细胞测序、动植物基因组测序、人基因组测序、外显子组测序、转录组测序、宏基因组测序、HI-C测序以及(b)Hi-C热图呈现15条染色体组装质量;(c)LAI(LTR Assembly Index)评估铁观音基因组和已发表茶树基因组组装质量;(d)铁观音单倍体参考获得了以下三方面研究结果:一是利用ImageTitle单分子测序和Hi-C技术绘制了木薯栽培品种SC205参考基因组图谱,Scaffold N50图2.(A)中华蟾蜍基因组全景;(B)不同动物类群基因组的基因区及基因间区长度示意图1 GH06和ZY821基因组的特征、两个亲本品系和两个极端群体的表型以及重组自交系的QTL-seq结果。成功分型出两套单体型。最后结合遗传图谱和Hi-C数据,将两套单体型实现染色体水平组装。近日,中国科学院海洋研究所在贝类基因组学研究方面取得新进展,发布了我国重要经济贝类——脉红螺的高质量染色体水平参考基因研究成果在线发表于 Cell (图片来自 Cell 官网) 此前我们已经知道,包括人类在内的四足动物的祖先是一种鱼,来自大海,由于在将高压冷冻替代技术与传统Hi-C技术相结合,开发出了“冷冻置换Hi-C”技术,填补了该领域利用冷冻样本研究染色体三维构象的空白,中科院动物研究所研究员胡义波团队利用多种测序策略(三代Nanopore测序+二代Illumina测序+Hi-C测序),构建了扭角羚染色体级别本站消息 日前,云南农业大学盛军教授团队通过Illumina、ImageTitle和Hi-C等多组学技术的整合,完成了草地贪夜蛾染色体水平基因组论文第一作者、中国林科院副研究员张苏芳说,马尾松树体本身分泌的松脂、松香等化合物在物理性和化学性上能阻挡大部分害虫对其Hi-C)发现,在缺铁培养条件下集胞藻三维基因组结构发生显著变化,基因组上0.1M区域的互作强度明显增加。改进后的Hi-C方法能够利用少量细胞生成高分辨率的Hi-C图谱,这有利于拓展了Hi-C技术的应用范围,尤其是为研究稀有临床样本的染色相关成果以“scHi: a deep learning framework for predicting cell cycle phases from single-cell Hi-C data using multi-scale interactionTimothy 博士表示,未来可以基于品种间Hi-C基因组定位,在威宁黑麦和Lo7基因组间进行系统的结构比较,研究不同品系黑麦基因组间此外,对于影响口感的肌肉脂肪含量方面,研究团队采用高通量染色质空间构象捕获技术(Hi-C)重构了猪脂肪组织的三维基因组空间论文通讯作者、浙江大学教授李飞告诉《中国科学报》,他们利用ImageTitle和Hi-C技术,对浙江省内采集的草地贪夜蛾样本进行测序,这次我们采用最新的三代测序技术和Hi-C技术获得的茄子基因组,在组装质量和连续性上远远高于国外研究团队的基因组版本。
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早在2018年,高分辨率日冕成像仪(Hi-C)就捕获了这一原始数据。正如它的名字所告诉我们的那样,高分辨率日冕成像仪是一架可...
专家利用三代ImageDescription数据、Illumina数据和三维基因组Hi-C数据,组装获得梅花鹿高质量染色体级别参考基因组,染色体挂载...
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他带领团队成功开发多项技术发明专利,应用于基因组组装技术、基因组重测序分析技术、Hi-C技术以及肿瘤检测相关的产品,且在生命...
光学图谱与Hi-C三维基因组联合分析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而对400多份种质资源开展了基因组变异分析,共鉴定近...
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10月20日下午我院在Hi-C空间多功能厅成功举办“唯才唯青岛杯”第十四届大连海事大学学生职业生涯规划大赛航运经济与管理学院...
2019年,学校获评全国创新创业典型经验高校(50强),2020年学校Hi-C空间获评国家级众创空间,2022年获批首批“国家级创新...
图1. DM8.1基因组完成图 研究首先利用ONT ultra-long reads进行三代组装和Hi-C挂载,获得了基因组大小、完整度和连续性均显著...
此研究结合二代、三代基因组测序和Hi-C数据,组装了包含22条染色体2.13 Gb的中华水韭四倍体基因组,其scaffold N50达到86.66...
为了检测增强子劫持事件,研究人员通过异常的Hi-C信号预测了SV,并利用同一实验室研发的软件预测SV 诱导的新染色质环,随后在...
10月18日下午,创新创业学院在Hi-C空间多功能厅举办了科创项目开展与技能实训系列活动第一期之“科创项目的开展流程与团队组建...
利用Hi-C,他们研究了基因组构型在感染期间如何与CD8+ T细胞分化相结合,并研究了CTCF(一种关键的染色质重塑因子)通过CTCF敲...
研究员 北京大学第三医院生殖医学中心 任北京大学第三医院临床干细胞研究中心常务副主任,生殖内分泌与辅助生殖技术北京市重点...
本研究利用ImageTitle+ImageTitle+Hi-C+Illumina多层级的策略完成了首个人工合成多倍体的染色体水平基因组组装,并对其亚基因组...
b). Hi-C验证3号染色体倒位准确性。c). 基于624份自交后代的重组率分布图,3号染色体倒位区域附近重组率显著降低 | 参考文献[1]
结合Hi-C互作图谱技术辅助基因组组装,分别构建了野牦牛和家牦牛高质量染色体水平参考基因组(分别命名为NWIPB_ImageTitle和...
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该研究基于三代长读长测序和Hi-C技术,获得了羊踯躅杜鹃花端到端gap-less基因组组装。该基因组组装大小为653.46 Mb,99.48%的...
Hi-C辅助组装技术组装到染色体水平基因组(图1a)。基因家族鉴定及分析结果表明,龙眼中的苯丙烷类生物合成相关基因家族数量...
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他们采用了Hi-C(染色质构象捕获),这是一种评估DNA和蛋白质组合以探究三维基因组结构的标准方法,适用于纳米孔测序或长而连续...
研究中,科研团队利用二代Illumina、三代ImageTitle、Hi-C和10ImageTitle等最新的基因组测序数据,通过优化基因组组装策略,完成...
西电学子在计算生物信息学领域顶级期刊发表成果 该方法被用于17个人类血液细胞promoter-capture Hi-C图谱。该研究指出ImageTitle...
当前上线的产品类型涵盖单细胞测序、动植物基因组测序、人基因组测序、外显子组测序、转录组测序、宏基因组测序、HI-C测序以及...
该研究采用Illumina, Nanopore和Hi-C等多种测序技术对云杉花墨天牛进行了基因组测序与组装,并将组装结果挂载到10条假染色体上...
利用单分子实时测序(SMRT)和Hi-C技术,在国际上首次获得了达到染色体级别的高质量巴西橡胶树优良品种GT1的参考基因组序列,并...
10x genomeics(130X)和Hi-C染色体构象捕获技术(176X),总计产生了近3 Tb的测序数据量。 最终,基因组组装大小约4.55 Gb...
据黄振宇博士介绍,研究团队首先利用二代、三代及Hi-C等测序技术绘制了李杏种质改良团队自主选育品种‘中李6号’基因组图谱,其...
近日,南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)魏辅文院士团队研究利用三代ImageTitle结合Hi-C测序技术,首次获得了箱鲀科鱼类的...
该研究不仅成功组装了中国大豆品种ZH13的T2T基因组,还绘制了首个完整的表观遗传修饰图谱,解析了大豆复杂区域(着丝粒与端粒...
然后利用统计网络对原始测序数据实现染色体级别的分离,该网络模型同时也可以Hi-C、Bionano、近亲或者同物种参考基因组组信息...
该研究通过ImageTitle三代测序和Hi-C辅助基因组组装,测序获得花楸树全长基因组序列,大小为660 Mb,定位于17条染色体,contig...
安诺优达深度参与了本次研究,包括ImageTitle三代测序、Hi-C辅助组装以及RNA-seq、WGBS等多组学测序及该基因组的组装、注释等...
狮头鹅基因组大小为1.2 G,结合染色体构象技术(Hi-C),得到40条染色体的高质量基因组,并成功绘制出狮头鹅全基因组精细图谱。
此外黄捷、蒋永鹏为稍早前BAT Hi-C方法学文章的共同第一作者。以上研究受到国家自然科学基金、科技部重点研发计划、北大-清华...
2020年,李兴旺教授和李国亮教授课题组与杨芳教授课题组合作,用DLO Hi-C技术描绘了玉米雌雄穗的三维基因组图谱。 鉴于课题组在...
2020年,他们和杨芳教授合作,又用DLO Hi-C技术描绘了玉米雌雄穗的三维基因组图谱,相关研究成果得到了国内外同行的高度评价。...
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(b)Hi-C热图呈现15条染色体组装质量;(c)LAI(LTR Assembly Index)评估铁观音基因组和已发表茶树基因组组装质量;(d)铁观音单倍体参考...
获得了以下三方面研究结果:一是利用ImageTitle单分子测序和Hi-C技术绘制了木薯栽培品种SC205参考基因组图谱,Scaffold N50...
近日,中国科学院海洋研究所在贝类基因组学研究方面取得新进展,发布了我国重要经济贝类——脉红螺的高质量染色体水平参考基因...
研究成果在线发表于 Cell (图片来自 Cell 官网) 此前我们已经知道,包括人类在内的四足动物的祖先是一种鱼,来自大海,由于在...
将高压冷冻替代技术与传统Hi-C技术相结合,开发出了“冷冻置换Hi-C”技术,填补了该领域利用冷冻样本研究染色体三维构象的空白,...
中科院动物研究所研究员胡义波团队利用多种测序策略(三代Nanopore测序+二代Illumina测序+Hi-C测序),构建了扭角羚染色体级别...
本站消息 日前,云南农业大学盛军教授团队通过Illumina、ImageTitle和Hi-C等多组学技术的整合,完成了草地贪夜蛾染色体水平基因组...
论文第一作者、中国林科院副研究员张苏芳说,马尾松树体本身分泌的松脂、松香等化合物在物理性和化学性上能阻挡大部分害虫对其...
改进后的Hi-C方法能够利用少量细胞生成高分辨率的Hi-C图谱,这有利于拓展了Hi-C技术的应用范围,尤其是为研究稀有临床样本的染色...
Timothy 博士表示,未来可以基于品种间Hi-C基因组定位,在威宁黑麦和Lo7基因组间进行系统的结构比较,研究不同品系黑麦基因组间...
此外,对于影响口感的肌肉脂肪含量方面,研究团队采用高通量染色质空间构象捕获技术(Hi-C)重构了猪脂肪组织的三维基因组空间...
论文通讯作者、浙江大学教授李飞告诉《中国科学报》,他们利用ImageTitle和Hi-C技术,对浙江省内采集的草地贪夜蛾样本进行测序,...
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